Iranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231222Chickpea chlorotic dwarf virus: genome sequence of the virus from two new natural hosts, associated alphasatellite and demonstration of the pathogenesis in okra plantویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی: تعیین ترادف ژنوم ویروس در دو میزبان جدید، آلفاستلایت همراه و اثبات بیماریزائی در گیاه بامیه21823070741510.22034/ijpp.2023.2008218.422FAخدیجهسالاریعضو هیات علمی دانشگاه جیرفتجهانگیرHeydarnejadبخش گیاهپزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کد پستی 7616914111حسینمعصومیبخش گیاهپزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کد پستی 7616914111Journal Article20230731Chickpea chlorotic dwarf virus (Mastrevirus, Geminiviridae) is a destructive geminivirus worldwide. In this study, symptomatic okra and wild jute samples showing typical geminivirus symptoms were collected from Jiroft farms and circular molecules of extracted DNA were enriched using rolling circle amplification (RCA) method followed by cloning and sequencing of RCA products of two selective samples from okra and wild jute. Sequence analysis showed that two isolates belong to strain CpCDV-F. Attempts to recover associated alpha- and betasatellite molecules from two plant samples using polymerase chain reaction assay resulted in detection of Gossypium darwinii symptomless alphasatellite (GDarSLA) only in wild jute sample. Sequence analyses indicated that two new CpCDV isolates shared nucleotide identity of 98% with each other and two viral and one alphasatellite sequences are closely related to Iranian Genbank isolates. Pathogenesis tests using previously constructed infectious clone of CpCDV led to appearance of yellowing and dwarfing in agroinoculated okra seedlings. Based on the results of this study, okra and wild jute plants are reported as new hosts of the CpCDV in Iran and wild jute is the new virus host in the world.ویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی (Chickpea chlorotic dwarf virus, CpCDV) از جنس Mastrevirus و خانوادۀ Geminiviridae، یکی از ویروسهای مخرب در تعداد زیادی از گیاهان در مناطق مختلف دنیا است. در این مطالعه، نمونههای بامیه و علف هرز کتان هندی با علائم مشخص آلودگی به جمینیویروسها از مزارع شهرستان جیرفت جمعآوری شد و بعد از استخراج دی اِن اِ، مولکولهای حلقوی موجود در آن با روش تکثیر دایرۀ غلتان (rolling circle amplification, RCA) غنیسازی گردید. همسانهسازی و تعیین ترادف محصول آر سی اِ مربوط به دو نمونۀ انتخابی از دو گیاه فوق نشان داد که آنها به سویۀ F مربوط به CpCDV آلوده هستند. تلاش برای برای جداسازی آلفا و بتاستلایتهای همراه با نمونههای این دو گیاه با استفاده از آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز، تنها منجر به ردیابی آلفاستلایت بدون علائم پنبۀ داروینی (Gossypium darwinii symptomless alphasatellite, GDarSLA) در نمونۀ گیاه کتان هندی گردید. بررسیها نشان داد که درصد یکسانی ژنوم کامل بین دو جدایۀ جدید CpCDV به میزان 98 درصد بوده و بیشترین درصد یکسانی ژنوم کامل دو جدایه از ویروس و یک جدایه از آلفاستلایتِ همراه، مربوط به جدایههائی است که قبلا از ایران گزارش شدهاند. در آزمایشهای مربوط به بیماریزائی CpCDV، مایهکوبی سازۀ ساخته شده از قبل باعث ایجاد علائم زردی و کوتولگی در گیاه بامیه گردید. بر اساس نتایج بدست آمده، گیاهان بامیه و علف هرز کتان هندی به عنوان میزبانهای جدید CpCDV در ایران و گیاه کتان هندی برای اولین بار به عنوان میزبان جدید ویروس از دنیا گزارش میگردند.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_707415_dd65a7cebb730e80491046f9a84c1d2c.pdfIranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231224Identification of internal boll rot of cotton in Tehran, Golestan and Hormozgan provinces*شناسایی عوامل پوسیدگی داخلی غوزه پنبه در استانهای تهران، هرمزگان وگلستان*23124070953010.22034/ijpp.2023.1996425.402FAمرتضیعرب سلمانیعضو هیات علمیزینب ساداتطباطباییدانش آموخته کارشناسی ارشد پردیس ابوریحانحشمت الهامینیاناستاد بازنشسته پردیس ابوریحانJournal Article20230326Internal boll rot disease is one of the important diseases of cotton. All commercial cotton cultivars, especially the native varietes, are susceptible to the disease. The disease has been reported in pistachio, soybean, and pepper. Changes in the shape and weight of bolls, shedding of buds, flowers and bolls, and the appearance of brown spots on the fibers are symptoms of the disease in cotton. In order to identify the casual agent of the disease, 178 infected boll samples were collected from Tehran, Golestan and Hormozgan provinces, and 17 isolates were obtained from them, and their pathogenicity was evaluated in cotton and bell peppers. Agents were isolated in PDA medium containing yeast extract at a temperature of 30 degrees Celsius. Molecular identification was done by amplification of a part of ribosomal DNA by polymerase chain reaction and ITS1- ITS4 primers. All 17 samples isolated in cotton were pathogenic in Cotton and bell pepper. Two yeast species were identified, Filobasidium magnum was identified for the first time from Tehran province and Meyerozyma guilliermondii is reported for the first time from Iran in the Golestan province .بیماری پوسیدگی داخلی غوزه یکی از بیماریهای مهم پنبه است .همه ارقام تجاری پنبه به ویژه ارقام بومی، حساس به بیماری میباشند. بیماری در پسته، سویا و فلفل گزارش شده است. تغییر شکل وکاهش وزن غوزه، ریزش غنچه، گل و غوزه و ظهور لکهقهوهای بر روی الیاف از علایم بیماری در پنبه میباشند. به منظور شناسایی عامل بیماری، 178 نمونه غوزه آلوده از استانهایتهران، گلستان و هرمزگان جمع آوری و از آنها 17 جدایه مخمری جداسازی و بیماریزایی آنها بر روی غوزه پنبه و میوه فلفل دلمهای ارزیابی شد. برای جداسازی عوامل از محیط PDA حاوی عصارهمخمر دردمای 30درجه سلسیوس استفاده شد. شناسایی با روش تکثیر بخشی از DNA ریبوزومی به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز و آغازگر ITS1- ITS4 صورت گرفت. تمام 17 نمونه جداسازی شده درپنبه و میوه فلفل دلمهای بیماریزا بودند. گونه Filobasidium magnum برای اولین بار از استان تهران و گونه Meyerozyma guilliermondii برای اولین بار از ایران به عنوان عوامل پوسیدگی داخلی غوزه پنبه گزارش میشوند.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_709530_ab0f4bdce1b1e51c61c8fe8f4e57ac52.pdfIranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231222Fungal and oomycota species associated with citrus decline in Hormozgan provineگونههای قارچی و اُاُمیست همراه با بیماری زوال مرکبات در استان هرمزگان24127570953310.22034/ijpp.2023.2005737.417FAآزادهگودرزیبخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، بندرعباس، ایرانسیاوشسماویمدیریت حفظ نباتات، سازمان جهاد کشاورزی هرمزگان، بندرعباس، ایرانJournal Article20230627This study was conducted with the aim of isolation, identification, frequency determination and pathogenicity of fungal and oomycota species associated with citrus decline in six different locations of Hormozgan province. Isolation of fungi and oomycota was carried out from Bakraee and Mexican lime roots and local tangerine branches on general and semi-selective culture media. The isolates were identified at genus or species level based on morphological characteristics and sequence of ITS-rDNA and a part of TEF-1α gene. Frequency percentage of identified species was determined in surveyed locations based on numbers of cultivated plant pieces. Fusarium solani, Macrophomina phaseolina, Fusarium proliferatum, Alternaria sp., Rhizoctonia solani, Fusarium acutatum, Phoma sp., Fusarium sp.1 and Fusarium sp.2 with the frequency of 93.51%, 1.1%, 0.26%, 0.26%, 0.17%, 0.08%, 0.04% and 0.04%, respectively, and Pythium spp. and Phytophthora nicotianae with the frequency of 4.96% and 3.12%, respectively, were isolated from roots with rot. Fungal species isolated from branches with dieback symptoms were Alternaria spp., Neofusicoccum mediterraneum and Colletotrichum gloeosporioides with the frequency of 81.7%, 10.56% and 0.92%, respectively. Pathogenicity of three isolates from each species was tested on one-year-old seedlings of local tangerine on Bakraee. All the investigated isolates, except for Alternaria sp. and Pythium sp., were pathogenic on seedlings and caused symptoms similar to decline symptoms observed in citrus orchards. Pathogenicity of Alternaria sp.1 and N. mediterraneum isolates was tested on detached branches of local tangerine and pathogenicity of C. gloeosporioides was tested on one-year-old seedlings of local tangerine and all tested isolates were pathogenic.تحقیق حاضر با هدف جداسازی، شناسایی، تعیین فراوانی و بیماریزایی گونههای قارچی و اُاُمیست همراه با بیماری زوال مرکبات در شش منطقه مختلف از استان هرمزگان انجام گرفت. جداسازی قارچها و اُاُمیست-ها از ریشههای بکرایی و لیمو مکزیکی و شاخههای نارنگی محلی روی محیطهای کشت عمومی و نیمه-انتخابی انجام شد. جدایههای به دستآمده، براساس ویژگیهای ریختشناسی و توالی ناحیه ITS-rDNA و بخشی از ژن TEF-1α در سطح جنس یا گونه شناسایی شدند. درصد فراوانی هریک از گونهها براساس تعداد جدایههای به دستآمده از قطعات گیاهی کشتشده تعیین شد. قارچهای Fusarium solani، Macrophomina phaseolina، Fusarium proliferatum، Rhizoctonia solani، Fusarium acutatum، Phoma sp.، Fusarium sp. 1 و Fusarium sp. 2 به ترتیب با فراوانی 51/93، 1/1، 26/0، 26/0، 17/0، 08/0، 04/0 و 04/0 درصد، و اُاُمیستهای Pythium spp. و Phytophthora nicotianae به ترتیب با فراوانی 96/4 و 12/3 درصد از ریشههای دارای پوسیدگی جداسازی شدند. گونههای قارچی جداسازیشده از شاخه-های دارای سرخشکیدگی شامل Alternaria spp.، Neofusicoccum mediterraneum و Colletotrichum gloeosporioides به ترتیب با فراوانی 7/81، 56/10 و 92/0 درصد بودند. بیماریزایی سه جدایه از هر یک از گونهها روی نهالهای یکساله نارنگی محلی با پایه بکرایی مورد آزمون قرار گرفت. تمام جدایهها، به جز جدایههای Alternaria sp. و Pythium sp.، روی نهالهای نارنگی بیماریزا بودند و نشانههایی مشابه با نشانههای زوال مشاهدهشده در باغهای مرکبات ایجاد نمودند. بیماریزایی جدایههای Alternaria sp. 1 و N. mediterraneum روی شاخههای بریده نارنگی محلی و بیماریزایی C. gloeosporioides روی نهالهای یکساله نارنگی محلی مورد آزمون قرار گرفت که تمام جدایههای مورد بررسی بیماریزا بودند.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_709533_ba6d073537a84f5c83a604364bf7a6e6.pdfIranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231222New record of the oomycete Pustula junggarensis (Albuginales, Oomycota) from Iranگونه (Albuginales, Oomycota) Pustula junggarensis، گزارشی جدید برای زیستگان اُاُمیستی ایران27328070953210.22034/ijpp.2023.1999412.409FAمحمد رضامیرزاییمرکز تحقیقات بیرجندناصررادماندانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایرانمحمدسالاریدانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایرانرسولزارعموسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایرانمهدیپیرنیاگروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابلشیراحمدسارانیگروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایرانJournal Article20230521The oomycete pathogens causing white blister rusts on members of Asteridae comprise different species within the genus Pustula (Albuginales, Oomycota). During the collection of white blister rust specimens in the South Khorasan province (eastern Iran) in April 2019, a specimen collected from Takhtajaniantha pusilla (Asteraceae), was identified morphologically as Pustula junggarensis (Albuginales, Oomycota). BLAST search using the ITS nrDNA sequence data, confirmed the identification. Also, the phylogenetic analysis using cox2 sequences clustered the species in the same clade with P. junggarensis sequences from China. This is the first record of P. junggarensis in Iran. To the best of our knowledge, this is the first report of a disease caused by a causative fungal/fungal-like agent on T. pusilla in Iran.بیمارگرهای اُاُمیستی عامل زنگ سفید روی میزبانهای Asteridae در جنس Pustula (Albuginales, Oomycota) قرار میگیرند. در هنگام جمعآوری نمونههای زنگ سفید در استان خراسان جنوبی (شرق ایران)، در فروردین 1398، نمونهای از بیماری روی میزبان Takhtajaniantha pusilla متعلق به تیره Asteraceae بر مبنای خصوصیات ریختشناختی، گونهیPustula junggarensis (Albuginales, Oomycota) شناسایی شد. همچنین، بر اساس واکاوی فیلوژنتیکی مبتنی بر توالییابی بخشی از ژن cox2، نمونه در تبار نمونههای P. junggarensis از چین قرار گرفت. بر اساس دادههای توالییابی ناحیه ترانویسی شده داخلی (ITS) دی ان ای ریبوزومی و مقایسه آن با توالیهای موجود در بانک ژن نیز شناسائی گونه تأیید شد. این نخستین گزارش از آرایه P. junggarensis برای زیستگان اُاُمیستی ایران است. بر اساس اطلاعات ما، این یافته اولین گـزارش از وقـوع یک بیماری قارچی/شبه قارچی روی میزبان T. pusilla در کشور نیز میباشد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_709532_de6d8ac8cfa0fe919dc77cec93d993e7.pdfIranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231222Effect of seed bio-/chemo-priming on Rhizoctonia root rot of common bean (Phaseolus vulgaris L.)تاثیر آماده باش زیستی و شیمیایی بذر بر پوسیدگی ریزوکتونیایی ریشه لوبیا (Phaseolus vulgaris L.)28130071010210.22034/ijpp.2023.2011943.430FAآمنهجوکارگروه بیماری شناسیگیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرسمهدیسعادتیگروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرسناصرصفائیگروه بیماری شناسیگیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرسمسعودشمس بخشدانشگاه تربیت مدرسJournal Article20230919Rhizoctonia root rot disease of common bean (Phaseolus vulgaris L.), caused by Rhizoctonia solani AG4, is one of the most important bean diseases worldwide. The use of biological and non-biological prime agents has become a promising and environmentally friendly alternative to the management of soil-borne pathogens. Therefore, the present study aimed to compare the effect of Bacillus subtilis isolate A4 (biological prime) and beta-aminobutyric acid (BABA) (non-biological prime) on the management of Rhizoctonia root rot disease in Talash and Sadri cultivars of common bean plants. The seeds were coated with the mentioned priming agents and after drying, they were planted and kept in the greenhouse at a temperature of 20±2 °C. Plants at the cotyledon stage were inoculated by R. solani AG4 inoculum. The induction of resistance in plants was evaluated by measuring disease severity, morphological, and physiological factors three weeks after inoculation. The priming factors increased almost all morphological and physiological measured traits, compared to the control. The plants treated with prime agents had a lower disease severity index (DSI) compared to the control plants and the Talash cultivar treated with B. subtilis had the lowest DSI, with a 59% reduction. The phenol content, catalase and peroxidase enzyme activities under bio-priming and chemo-priming treatments in the presence of the pathogen showed a significant increase compared to the control plants.بیماری پوسیدگی ریزوکتونیایی ریشه لوبیا (Phaseolus vulgaris L.) که توسط Rhizoctonia solani AG4 ایجاد میشود، یکی از بیماریهای مهم لوبیا در جهان است. استفاده از عوامل آمادهباش زیستی و غیرزیستی به جایگزینی امیدوارکننده و سازگار با محیط زیست در مدیریت بیماریهای گیاهی تبدیل شده است. از اینرو پژوهش حاضر با هدف مقایسه تأثیر جدایه A4 باکتری Bacillus subtilis (آماده-باش زیستی) و بتا آمینو بوتریک اسید (BABA) (آمادهباش غیرزیستی) در مدیریت بیماری پوسیدگی ریشه در دو رقم تلاش و صدری لوبیا انجام شد. بذور لوبیا به عوامل یادشده آغشته شده و پس از خشک شدن کشت و در گلخانه 2±20 درجه سلسیوس نگهداری شدند. در مرحله کوتیلدونی، گیاهان با زادمایهAG4 solani R. مایهزنی شدند. میزان مقاومت القاء شده در گیاهان با اندازهگیری شاخص شدت بیماری، فاکتورهای ریختشناختی و فیزیولوژیک بعد از گذشت سه هفته از مایهزنی بررسی شد. نتایج نشان داد که عوامل آمادهباش باعث بهبود صفات ریختشناختی و فیزیولوژیک اندازهگیری شده نسبت به شاهد شدند. میزان شاخص شدت بیماری در گیاهان تیمار شده با عوامل آمادهباش کمتر از شاهد بود و کمترین شاخص شدت بیماری در رقم تلاش تیمار شده با B. subtilis، به میزان 59 درصد کاهش مشاهده شد. محتوای فنول، فعالیت آنزیم کاتالاز و پراکسیداز تحت تیمار با جدایه B. subtilis و BABA در حضور بیمارگر نسبت به گیاهان شاهد افزایش معنیدار نشان دادند.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_710102_59b7bb1cdf54ccf0ccf29d32574853be.pdfIranian Plant Pathology Societyبیماریهای گیاهی0006-277458420231222Identification of watermelon as a new natural host of chickpea chlorotic dwarf virus in Iranشناسائی هندوانه به عنوان میزبان طبیعی جدید ویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی در ایران30130470953410.22034/ijpp.2023.2010064.424FAمریماسماعیلیدانشگاه شهید باهنر کرمانجهانگیرحیدرنژاداستاد دانشگاه شهید باهنر کرمانJournal Article20230826In recent years, yield losses due to chickpea chlorotic dwarf virus (CpCDV, Mastrevirus, Geminiviridae) infection have been intensified in a large number of plants such as watermelon, okra and cotton and the virus has been reported around the world (Kanakala and Kuria 2018). In the current study, natural infection of watermelon with CpCDV was investigated. Watermelon samples showing leaf chlorosis, hardness and discoloration of the flesh with whitish stripes, deformation and increasing seed abortion of fruits (Fig. 1) were collected from watermelon-growing farms in Behbahan (Khuzestan Province) in 2018. Total DNA of the samples was extracted from leaf tissue using the cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) method followed by the enrichment of the extracted circular DNA molecules by rolling circle amplification (RCA) method using phi 29 DNA polymerase (TempliPhi kit, GE Healthcare, USA). Polymerase chain reaction (PCR) tests using RCA product as DNA template and the primer pair CpCDV-752-F/CpCDV-1326-R (Askari et al. 2021) resulted in the amplification of an expected 575 bp DNA fragment (Fig. 2) indicating the infection of the all tested samples with CpCDV. The definitive infection of a PCR positive sample (W1) with CpCDV was confirmed by sequencing of PCR product.در سالهای اخیر، خسارت ویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی (chickpea chlorotic dwarf virus, CpCDV، از جنس Mastrevirus و خانوادۀ Geminiviridae) در تعداد زیادی از گیاهان مانند هندوانه، بامیه و پنبه شدت گرفته و این ویروس از نقاط مختلف دنیا گزارش شده است (Kanakala and Kuria 2018). در تحقیق حاضر، آلودگی طبیعی هندوانه به CpCDV در مزارع مورد بررسی قرار گرفت. در سال 1397، ده نمونۀ هندوانه با علائم سبزردی برگها، سفتی، تغییر رنگ با ایجاد رگههای سفید در داخل میوه، عدم تقارن و افزایش بذرهای عقیم در میوه (شکل 1) از مزارع آلودۀ هندوانه در بهبهان (استان خوزستان) جمعآوری شدند. دی اِن اِی کل نمونهها به روش cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) از بافت برگ استخراج گردید و مولکولهای دی اِن اِی حلقوی موجود در آنها به روش تکثیر دایرۀ غلتان (rolling circle amplification, RCA) با استفاده از آنزیم فی 29 دیاِناِی پلیمراز (TempliPhi, GE Healthcare, USA) غنیسازی گردید. از محصول RCA حاصل به عنوان رشتۀ الگو به همراه جفت آغازگر CpCDV-752-F/CpCDV-1326-R (Askari et al. 2021) در آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز استفاده گردید. این آزمون، منجر به تکثیر قطعۀ قابل انتظار به اندازۀ 575 جفت باز برای هر ده نمونه گردید (شکل 2) که آلودگی نمونهها به CpCDV را اثبات نمود. تعیین ترادف نوکلوتیدی محصول واکنش زنجیرهای پلیمراز مربوط به نمونۀ W1، آلودگی قطعی آنرا به CpCDV تأیید نمود.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_709534_92b357a18492cb50fd3f42765c6b1ceb.pdf