تعیین مشخصات ژنوم ویروس پیچیدگی برگ فلفل، آلفاستالیت و بتاستالیتهای همراه و اثبات بیماری زائی ویروس در جنوب شرق

نوع مقاله : مقاله کامل پژوهشی

نویسندگان

1 گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان بخش گیاه پزشکی، دانشکده کشاورز ی، دانشگاه جیرفت

2 بخش گیاهپزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

10.22034/ijpp.2024.710581

چکیده

بگوموویروس های آلوده کنندۀ سبزی جات، یکی از عوامل اصلی کاهش عملکرد ا ین گی اهان در جنوب شرق ایران محسوب می گردند. در این مطالعه، وقوع ویروس پیچ یدگی برگ فلفل )ChiLCV, virus curl leaf chili )و ستالیت های همراه آن در مزارع کاشت فلفل و گلخانه های تجارتی جیرفت و منوجان واقع در استان کرمان مورد بررسی قرار گرفت. ژنوم کامل سه جدایۀ ChiLCV به روش دای رۀ غلتان تکث یر شد و بعد از همسانه سازی، تعیی ن ترادف گردید. همچن ین، ژنوم آلفا- و بتاستالیت های همراه بهترتیب با استفاده از آغازگرهای اختصاصی و عمومی و آزمون واکنش زنجی ره ا ی پلیمراز تکثی ر، همسانه سازی و تعیین ترادف گردیدند. براساس مقای سه های صورت گرفته، درصد یکسانی ژنوم کامل ویروس بین سه جدایۀ ایران با جدایه های منتخب از ژن بانک باالتر از 95 درصد بدست آمد. در هر سه جدایۀ مورد بررسی، وجود آلفاستالیت بدون عالئم پنبۀ داروینی ) GDarSLA, alphasatellite symptomless darwinii gossypium )با می زان یکسانی ترادف نوکلئوت یدی باالی 89 درصد در مقایسه با جدایه های منتخب از ژنبانک و همچنین در دو جدایه از منوجان، وجود بتاستالیت پیچیدگی برگ گوجه فرنگی )ToLCB, betasatellie curl leaf tomato )با درصد یکسانی باالی 94 درصد در مقایسه با جدایه های منتخب از ژنبانک اثبات گرد ید. در آزمون بیماری زائی، سازۀ دوپار ناقص طراحی و ساخته شد. این سازه، بعد از مایه زنی به گیاهچههای فلفل، باعث ا یجاد عالئم کوتولگی و پیچیدگی برگ شد. بر اساس نتایج بدست آمده، ChiLCV یکی از بگوموویروسهای آلوده کنندۀ گی اه فلفل در جنوب شرق ا یران بوده و ژنوم کامل ویروس و وجود آلفاستال یت همراه با آن برا ی اولین بار از ایران گزارش می شود. 

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genome characterization of chili leaf curl virus, the associated alphasatellite and betasatellite and demonstration of pathogenesis of the virus in south-eastern Iran

نویسندگان [English]

  • Asra Salari 1
  • Jahangir Heydarnejad 2
  • Hossain Massumi 2
1 PhD student of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran College of Agriculture, University of Jiroft, Jiroft, Iran
2 College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
چکیده [English]

Begomovirus infecting vegetables is one of the main components of yield losses in south-eastern Iran. In this 
study, the incidence of chili leaf curl virus (ChiLCV) and the associated satellites were studied in pepper 
farms and commercial greenhouses of Jiroft and Manoojan (Kerman province). Full-length genome of three 
ChiLCV isolates was amplified using the rolling circle amplification method followed by cloning and 
sequencing. Furthermore, associated alpha- and betasatellites genomes were amplified in the PCR assay 
using specific and degenerate primer pairs, respectively. Sequence comparison showed that three ChiLCV 
isolates shared >95% pairwise nucleotide identities with the selected GenBank isolates. Gossypium darwinii 
symptomless alphasatellite (GDarSLA) was also found to be associated with three ChiLCV isolates and 
shared >89% pairwise identities with the selected GenBank isolates. Furthermore, tomato leaf curl 
betasatellie (ToLCB) was identified in two pepper isolates from Manoojan and shared >94% pairwise 
identities with the selected GenBank isolates. To demonstrate the pathogenesis of ChiLCV, a partial dimer of 
the viral genome was designed, constructed and agroinoculated into pepper seedlings. This led to the 
appearance of typical ChiLCV symptoms, including dwarfing and yellowing. Collectively, ChiLCV is one of 
the important begomoviruses infecting pepper in south-eastern Iran and the full-length genome of the virus 
as well as the associated alphasatellite are reported for the first time in Iran.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Key words: Gossypium darwinii symptomless alphasatellite
  • Tomato leaf curl betasatellie
  • Begomovirus
  •  Rolling circle amplification