شناسایی تتراد واریانت های جدید ویروس نکروتیک زردی رگبرگ چغندرقند در ایران

نوع مقاله : مقاله کامل پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار، بخش تحقیقات چغندرقند، مرکز تحقیقات و آموزش و منابع طبیعی خراسان رضوی، سازمان تحقیقات ،آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران

2 دانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی ، مشهد، ایران

چکیده

ریزومانیا یک بیماری ویروسی مخرب در چغندرقند است. این بیماری توسط ویروس زردی نکروتیک رگبرگ چغندرقند (beet necrotic yellow vein virus; BNYVV; Benyvirus necrobetae) ایجاد می‌شود. علیرغم شناسایی ژن‌های مقاومت، BNYVV به دلیل شکست مقاومت و همچنین توانایی آن برای زنده ماندن برای مدت طولانی در اسپورهای در حال استراحت قارچ ناقل داخل خاک، به‌عنوان یک محدودیت اصلی کشت چغندرقند باقی‌مانده است. در این بررسی، پس از جمع‌آوری ریشه‌های آلوده با علائم شدید بیماری ریزومانیا در ژنوتیپ‌های چغندرقند مقاوم حامل ژن Rz1 از مزارع کشت چغندرقند استان خراسان رضوی، استخراج آران ای کل از ریشه، BNYVV با استفاده از روش آزمون زنجیره‌ای پلیمراز همراه با ترانویسی معکوس ردیابی شد. جدایه های ویروس برای حضور RNA5 و RNA3 با استفاده از روش آزمون زنجیره‌ای پلیمراز همراه با ترانویسی معکوس به ترتیب باهدف قراردادن ژن‌های P26 و P25 موردبررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که همه جدایه‌های موردبررسی BNYVV از نوع A بوده و تیپ های B و P ردیابی نشدند. در ادامه ژن رمزکننده پروتئین P25 رشته RNA3 این جدایه‌ها، همسانه‌سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی شدند. تعیین توالی 650 جفت‌بازی از پروتئین P25، هشت نوع تتراد واریانت در ناحیه موسوم به تتراد (aa67-70) شناسایی شد. این تتراد واریانت ها شامل ACHG، AHHG، TLHG، VHHG، VCHG،AYHG، ALHG و ARHG بودند که از این تعداد سه واریانت‌ TLHG، ARHG و VCHG برای اولین بار است که از مزارع چغندرقند استان خراسان و ایران گزارش می‌شود و تتراد VCHG قبلا به عنوان واریانت شکننده مقاومت شناسایی شده است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification of new tetrad variants of beet necrotic yellow vein virus (Benyvirus necrobetae) in Iran

نویسندگان [English]

  • jamshid soltani idliki 1
  • mohsen mehrvar 2
1 Assistant Professor, Sugar Beet Research Department, Khorasan Razavi Agricultural and Natural Resources Research and Education Center, AREEO, Mashhad, Iran.
2 Associate Professor, Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran.
چکیده [English]

Rhizomania is a destructive viral disease in sugar beet. It is caused by the beet necrotic yellow vein virus (BNYVV; Benyvirus necrobetae), and, a Benyvirus transmitted by the soil inhabiting plasmodiophorid Polymyxa betae. Despite identification of resistance genes, BNYVV remains a major constraint because of resistance-breaking events as well as its ability to survive for long periods in soils in resting spores of P. betae. In this study, severe symptoms of rhizomania disease were observed in resistant sugar beet genotypes carrying the Rz1 gene in the fields, which indicated the resistance-breaking events. Plants from severely infected fields were sampled and total RNA was extracted from root hairs. BNYVV was detected using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The virus isolates were tested for the presence of RNA5 and RNA3 using RT-PCR targeting P26 and P25 genes, respectively. The results showed that all the tested BNYVV isolates were type A However, types B and P were not detected. Next, the P25 protein coding gene of the RNA3 strand of these isolates was sequenced and nucleotide synonyms were determined. Determining the sequence of 650 base pairs of P25 protein, eight types of tetrad variants were identified in the so-called tetrad region (aa67-70). These tetrad variants included ACHG, AHHG, TLHG, VHHG, VCHG, AYHG, ALHG and ARHG, of which three variants TLHG, ARHG and VCHG are reported for the first time from the sugar beet fields of Khorasan province and Iran.

کلیدواژه‌ها [English]

  • "Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR)"
  • "Rhizomania disease"
  • "Tetrad variant
  • " "Sugar beet
  • Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV)"