شناسایی و بررسی مولکولی ویروس موزاییک زرد زعفران در استان های خراسان جنوبی و رضوی

نوع مقاله : مقاله کامل پژوهشی

نویسندگان

1 عضو هیات علمی دانشگاه بیرجند

2 دانشجوی دکترا

3 محقق مرکز تحقیقات کشاورزی سیراد- کشور فرانسه

چکیده

زعفران (Crocus sativus L.) یکی از محصولات با ارزش اقتصادی و فرهنگی ایران است که به‌صورت رویشی از طریق بنه تکثیر می‌شود و به‌دلیل آلودگی به ویروس‌ها، عملکرد و کیفیت آن تحت‌تأثیر قرار می‌گیرد. در این پژوهش، به‌منظور بررسی وضعیت آلودگی ویروسی زعفران و شناسایی مولکولی ویروس موزاییک زرد زعفران (Saffron yellow mosaic virus; SYMV)، از ۵۱ نمونه برگ زعفران جمع‌آوری‌شده از مزارع استان‌های خراسان جنوبی و رضوی در سال ۱۴۰۳ استفاده شد. استخراج اسید نوکلئیک وابسته به ویریون با روش VANA و توالی‌یابی با فناوری 454 pyrosequencing انجام شد. نتایج تحلیل متاژنومیک نشان داد که ویروس‌های متعلق به جنس Potyvirus، به‌ویژه SYMV، غالب‌ترین ویروس‌ها در جمعیت‌های زعفران ایران هستند. آزمون RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی جنس Potyvirus حضور SYMV را در چهار منطقه از جمله قائن، فردوس، بیرجند و تربت‌حیدریه تأیید کرد. توالی کامل ژنوم جدایه ایرانی (Ferdows-SYMV.IR) به طول 8917 نوکلئوتید تعیین و درخت فیلوژنتیکی با روش Maximum Likelihood ترسیم شد. نتایج فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه‌های ایرانی SYMV دارای شباهت نوکلئوتیدی ۹۷ تا ۱۰۰٪ با جدایه مرجع (OK632024) هستند و از ویروس‌های نزدیک مانند Bean yellow mosaic virus وClitoria yellow vein virus متمایز می‌باشند. علائم مشاهده‌شده شامل زردی، موزاییک و پیچیدگی برگ‌ها در گیاهان آلوده بود. این یافته‌ها برای نخستین‌بار حضور قطعی SYMV را در استان خراسان جنوبی و نیز ردیابی آن در خراسان رضوی تأیید می‌کند. نتایج این مطالعه بر لزوم پایش مستمر، توسعه روش‌های تشخیص اختصاصی و مدیریت ناقلین برای جلوگیری از گسترش ویروس‌های نوظهور زعفران تأکید دارد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification and Molecular Characterization of Saffron Yellow Mosaic Virus in South and Razavi Khorasan Province

نویسندگان [English]

  • SeyyedeAtefeh حسینی 1
  • Akram Tavakkoli Bardaskan 2
  • philippe Roumagnac 3
1 University of birjand
2 PhD student
3 Researcher at Sirad Agricultural Research Center - France
چکیده [English]

Saffron (Crocus sativus L.) is one of Iran’s most valuable crops, both economically and culturally. It is vegetatively propagated through corms and is affected by viral infections that reduce its yield and quality. In this study, to investigate the viral infection status of saffron and to molecularly identify Saffron yellow mosaic virus (SYMV), 51 saffron leaf samples were collected from fields in South and Razavi Khorasan provinces in 2024. Virion-associated nucleic acid (VANA) extraction was performed, followed by sequencing using 454 pyrosequencing technology. Metagenomic analysis revealed that viruses belonging to the genus Potyvirus, particularly SYMV, were the most prevalent in Iranian saffron populations. RT-PCR assays using Potyvirus-specific primers confirmed the presence of SYMV in four regions: Qaen, Ferdows, Birjand, and Torbat Heydariyeh. The complete genome sequence of the Iranian isolate (Ferdows-SYMV.IR) was determined to be 8,917 nucleotides long, and a phylogenetic tree was constructed using the Maximum Likelihood method. Phylogenetic analysis showed that Iranian SYMV isolates shared 97–100% nucleotide identity with the reference isolate (OK632024) and were distinct from closely related viruses such as Bean yellow mosaic virus and Clitoria yellow vein virus. Observed symptoms in infected plants included yellowing, mosaic patterns, and leaf curling. This study provides the first definitive evidence of SYMV presence in South Khorasan province and its detection in Razavi Khorasan. The findings highlight the importance of continuous monitoring, development of specific diagnostic tools, and vector management strategies to prevent the spread of emerging saffron viruses.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Crocus sativus
  • Saffron yellow mosaic virus
  • Potyvirus
  • VANA
  • Phylogenetics